Aquilegia pyrenaica subsp. discolor est la sous-espèce la plus remarquable et la plus distincte du groupe pyrenaica , et l'image présentée en illustre parfaitement la caractéristique fondamentale qui lui a valu son épithète infraspécifique : le terme latin discolor , signifiant « de deux couleurs » ou « bicolore », désigne précisément cette combinaison chromatique saisissante et immédiatement reconnaissable entre les sépales d'un violet-bleu intense et profond et les pétales d'un blanc crème à blanc jaunâtre pur, créant un contraste bicolore d'une élégance et d'une netteté absolument remarquables au sein du genre.
Sur la photographie, on distingue très clairement cette bicoloration caractéristique : les sépales étalés, larges et bien développés, arborent un violet lumineux et saturé tirant vers le bleu-mauve, tandis que les pétales internes forment une coupe centrale d'un blanc immaculé à peine teinté de crème ou de jaune très pâle, avec les étamines dorées visibles en son centre, ajoutant une troisième touche colorée qui enrichit encore la composition florale. Les éperons, bien visibles sur les boutons et les fleurs de profil, sont courts et recourbés en crochet à leur extrémité, conformément au type morphologique des ancolies européennes de montagne.
Cette sous-espèce est endémique d'une aire géographique particulièrement restreinte et précise, limitée aux montagnes cantabriques du nord de l'Espagne, principalement dans les provinces d'Asturies, de Cantabrie et de León, ce qui en fait un taxon à la fois rare, localisé et présentant un intérêt biogéographique et conservatoire certain. Elle pousse dans des habitats rocheux et des pelouses alpines d'altitude, dans des conditions similaires à celles décrites pour l'espèce type, mais avec une préférence marquée pour les substrats calcaires des massifs cantabriques.
La plante visible sur la photographie présente un port particulièrement compact et touffu, avec un feuillage vert vif abondant et dense formant un coussin bas sur lequel les fleurs se dressent en nombre généreux, caractère qui la rend extrêmement attractive en culture ornementale. Ce port nain et dense, combiné à la floraison abondante et au bicolore saisissant des fleurs, explique l'engouement des horticulteurs et des amateurs de plantes alpines pour ce taxon, qui est considéré comme l'une des plus belles ancolies naines pour la rocaille et les jardins alpins.
En horticulture, Aquilegia pyrenaica subsp. discolor est très appréciée et relativement recherchée dans les milieux spécialisés, cultivée en rocaille soignée, en auge alpine ou en pot dans un substrat très minéral et parfaitement drainant, à l'abri de l'humidité stagnante hivernale. Sa rusticité est bonne dans les régions à hivers froids et secs, mais elle peut souffrir sous les climats océaniques trop humides en hiver, exigeant alors une protection ou une culture sous châssis froid pour assurer sa pérennité.